Vanlige aminosyrer og proteinsyntese
Aminosyrene som forekommer hyppigst i proteinkonstruksjonene av levende organismer kalles vanlige aminosyrer eller proteinogener. Selv om mer enn 500 typer aminosyrer er kjent i naturen, er det bare tjue som vi kaller vanlig. Sammen med disse er det noen flere sjeldne, kalt sporadiske, som vanligvis kommer fra metabolismen av vanlige etter at de er innlemmet i proteinkjeden. I kollagen finnes for eksempel lysin og prolin, to vanlige aminosyrer, i den hydroksylerte formen (hydroksyprolin og hydroksylisin).
De fleste andre ikke-vanlige aminosyrer faller hovedsakelig i konstitusjonen av enzymer og hormoner av protein natur, eller heller peptid (husk at for å bli ansett som slik, må et protein bestå av mer enn 100 aminosyrer, mens man danner en oligo og ett polypeptid er tilstrekkelig fra 2 til 9 og fra 10 til 100).
Blant de 20 vanlige aminosyrene blir husket
Alanin, Arginin, Asparagin, Aspartinsyre, Cystein, Glycin, Glutaminsyre, Glutamin, Histidin, Isoleucin, Leucin, Lysin, Metionin, Fenylalanin, Prolin, Serin, Threonin, Tryptofan, Tyrosin, Valin
Eksempler på ikke-vanlige aminosyrer er:
karnitin (involvert i transport av langkjede fettsyrer inne i mitokondriene, der de er vant til å produsere energi);
ornithin, citrullin og homocystein (deltar i metabolisme av aminosyrer - urea syklus);
hydroksyprolin og hydroksylisin (del av sammensetningen av kollagen og noen proteiner);
sarcosin (eller metylglycin).
Noen aminosyrer kan også ha kommersiell eller farmakologisk betydning.
- Natriumglutamat brukes i næringsmiddelindustrien som smaksforsterker (se lagerbeholder).
- L-dihydroksyfenylalanin (L-DOPA) er et stoff som brukes til å behandle Parkinsons sykdom.
- 5-hydroksytryptofan (5-HTP) har blitt brukt til behandling av nevrologiske symptomer assosiert med fenylketonuri (en arvelig metabolsk sykdom som forhindrer bruk av fenylalanin, en essensiell aminosyre, på grunn av spesielle enzymmangler, akkumuleringen av fenylalanin i vevet er det ansvar for alvorlig skade på hud og nevrologi).
Planter og bakterier er i stand til å produsere bestemte aminosyrer, som kan finnes i peptidantibiotika, som nisin og alameticin.
Essensielle aminosyrer
Noen av de 20 vanlige aminosyrene kalles essensielle, da de ikke kan syntetiseres av kroppen fra andre forbindelser, men må tas med mat.
For mennesker er disse fenylalanin, leucin, isusin, lysin, metionin, treonin, tryptofan, valin og, hos barn, histidin og arginin.
Vanlige aminosyrer, kjemiske egenskaper
På grunnlag av de kjemiske egenskapene til den radikale R (gruppe av atomer som danner en ikke veldig lang kjede), kan aminosyrene deles inn i ulike kategorier.
Aminosyrer med apolar R (ikke i stand til å danne hydrogenbindinger):
med alifatisk kjede: alanin, leucin, isoleucin, valin, prolin
med aromatisk kjede: fenylalanin, tryptofan
med kjede inneholdende et svovelatom: metionin
Aminosyrer med polar R:
med OH-gruppe: serin, treonin, tyrosin
med SH-gruppen: cystein
med CO-NH2- gruppe : asparagin, glutamin
med H: glycin (den eneste ikke-chirale aminosyren)
Aminosyrer med grunnleggende R:
lysin, arginin, histidin
Aminosyrer med R-syre:
glutaminsyre, asparaginsyre
