Hos dyr varierer aviær influensasymtomatologi både i forhold til virusstammen involvert i infeksjonen og til de berørte artene. Særlig på fugler har infeksjonen et gunstig kurs, hvis det er forårsaket av lavpatogene virus som tilhører alle H-subtyper ( LPAI - lavpatogen aviær påvirkning ). Sykdommen forårsaket av LPAI-virus er lokalisert og preget av respiratoriske og enteriske symptomer, ofte forbundet med generell ubehag, tåre og reproduksjonsavvik hos husdyr (f.eks. Eggendringer og nedsatt egglegging).
I motsetning til dette kan enkelte virusstammer som tilhører subtypene H5 og H7 forårsake høypatogen aviær influensa ( HPAI - High Pathogenic Avian Influence ), en systemisk og alvorlig sykdom som alltid er forbundet med høy dødelighet mellom enkelte arter av vill- og husdyr. De mest tydelige symptomene er i nervesystemet, med depresjon av den sensoriske, bakovergående rotasjon av hodet og lammelse av vingene.
