Den såkalte putrefaktive tarmfloraen har evne til å fordøye proteiner og små peptider som har rømt fordøyelse og enterisk absorpsjon.
Forutsetning, ikke overraskende, er prosessen med dekomponering av proteiner. Det er heller ikke det faktum at et høyt proteinholdig kosthold favoriserer utviklingen av en overveiende putrefaktiv tarmflora.
Problemene stammer fra at bakteriene produserer forskjellige stoffer (aminer, ammoniakk, fenoler, indoler), fra proteiner. blant disse noen (spesielt aminer) gir flatulens en ubehagelig lukt (f.eks. putrescin og cadaverine), mens andre er spesielt giftige hvis ikke engang kreftfremkallende.
Tenk bare på nitrosasjonsreaksjonene hvorfra kreftfremkallende kompositter kan genereres, for eksempel nitroso-aminer. Dette vil forklare hvorfor en diett rik på kjøtt og lite frukt og grønnsaker er relatert til økt risiko for kolorektal kreft.
