Marburg- viruset heter sitt navn fra den homonymske tyske byen der den først ble vist i 1967, da den forårsaket tre samtidige utbrudd i Tyskland (byene Marburg og Frankfurt) og i det tidligere Jugoslavia (Beograd). I begge land ble Marburg-viruset sannsynligvis introdusert ved import av ugandiske grønne aper ( Cercopithecus aethiops, også kjent som Grågrønn Cercopiteco).
De første tilfellene ble registrert blant ansatte i et laboratorium i nær kontakt med disse primatene. Sekundære tilfeller involvert medisinsk personell på sykehus utsatt for infisert biologisk materiale.
Deretter ble sporadiske episoder eller utbrudd registrert i Sør-Afrika, Kenya, Den demokratiske republikken Kongo og Angola, for totalt 600 tilfeller og 480 dødsfall.