Kaffefrø, under industriell behandling, kan også brukes til produksjon av koffeinfri kaffe. Denne prosessen, kalt koffeinfrihet, finner sted når frøene fortsatt er grønne og ikke etter steking. Mange metoder kan brukes for å fjerne koffein fra kaffe, men alle inkluderer nedsenking av grønne frø i varmt vann (en prosess kjent som sveitsisk vannprosess) eller damp; på dette tidspunktet blir det tilsatt løsningsmidler som løser opp og separerer oljer som inneholder koffein fra frøene. Decaffeination brukes ofte av kaffeprosessorer som som en kilde til tilleggsinntekt selger koffein til farmasøytiske selskaper.
